The Colegio de San Juan de Letránបានចាប់ផ្តើមដោយហៅខ្លួនវាថា "Colegio para mestizos" ហើយត្រូវបានបង្កើតឡើងក្នុងឆ្នាំ ១៥៤៨ តាមគំនិតផ្តួចផ្តើមរបស់អេស្បាញលិង្គដែលបានឃើញការកើនឡើងនៃចំនួន mestizos ដែលកើតនៅក្នុងប្រទេសអេស្ប៉ាញថ្មីដែលទាមទារការអប់រំ។
The Colegio de San Juan de Letránបានចាប់ផ្តើមដោយហៅខ្លួនវាថា“ Colegio para mestizos” ហើយត្រូវបានបង្កើតឡើងក្នុងឆ្នាំ ១៥៤៨ តាមគំនិតផ្តួចផ្តើមរបស់អេស្បាញលិង្គដែលបានឃើញការកើនឡើងនៃចំនួន mestizos ដែលកើតនៅក្នុងប្រទេសអេស្បាញថ្មីដែលត្រូវការការអប់រំ។
ដើម្បីរកឃើញស្ថាប័ននេះពួកគេមិនបានស្នើសុំការអនុញ្ញាតពីលោក Viceroy Antonio de Mendoza ទេប៉ុន្តែផ្ទុយទៅវិញបានបញ្ជូនអ្នកតំណាងម្នាក់ទៅកាន់ប្រទេសអេស្ប៉ាញដើម្បីទទួលបានការអនុញ្ញាតពីព្រះមហាក្សត្រហើយដុន Gregorio de la Pesquera ត្រូវបានតែងតាំងសម្រាប់បេសកកម្ម។ អ្នកទទួលបន្ទុកនេះទទួលបានវិញ្ញាបនប័ត្ររាជការដែលបានចេញនៅថ្ងៃទី ១៨ ខែសីហាឆ្នាំ ១៥៤៨។ នៅពេលចាប់ផ្តើមមហាវិទ្យាល័យទទួលបានហ្គេមចំនួន ៦០០.០០០ ប៉េសូពីការជីករ៉ែការបរិច្ចាគឯកជននិងអំណោយ។
គាត់ត្រូវបានដឹកនាំដោយបូជាចារ្យបីនាក់គឺលោកជាសាកលវិទ្យាធិការនិងសមាជិកក្រុមប្រឹក្សាពីររូបដែលជាអភិបាលអាចមានរយៈពេលមួយឆ្នាំនៅក្នុងមុខតំណែងរបស់គាត់ហើយបន្ទាប់មកពីរនាក់ទៀតអាចកាន់កាប់ទីប្រជុំជន។ ការអានគោលលទ្ធិគ្រីស្ទានត្រូវបានបង្រៀនហើយបន្ទាប់មកសិស្សដែលមានកម្រិតខ្ពស់ត្រូវបានលើកទឹកចិត្តឱ្យទៅមហាវិទ្យាល័យ។
សាលានេះបានធ្លាក់ចុះនៅចុងសតវត្សរ៍ទី ១៨ បានរស់រានរហូតដល់ឯករាជ្យហើយនៅឆ្នាំ ១៨២១ សាលានេះបានទទួលការជម្រុញដ៏អស្ចារ្យប៉ុន្តែទីបំផុតវាបានបាត់ទៅវិញនៅឆ្នាំ ១៨៥៧ ។ វាបែរមុខទៅទិសខាងកើតទល់មុខអនុសញ្ញាសាន់ហ្វ្រាន់ស៊ីស្កូដែលកាន់កាប់ពេញផ្លូវ។